Utiliser le reséquençage et le typage des micro-organismes pour :
- Vérifier ou valider les mutations au niveau du génome
- Validez votre bio-production
- Caractériser les isolats microbiens par MLST
Considérations avant de commencer un projet de reséquençage microbien :
Existe-t-il un génome de référence ? Existe-t-il un profil MLST ? Des modifications plus importantes sont-elles prévues ? Une contamination significative de l'ADN peut-elle se produire ? Laissez-nous vous guider de la conception à l'analyse.
Exemples de projets utilisant le reséquençage microbien :
- Détecter la pathogénicité d'isolats d'ADN bactérien par MLST
- Vérifier/détecter les SNPS et les InDels
- Vérifier la spécificité d'une mutation introduite
- Vérifier l'épidémiologie moléculaire des souches potentiellement porteuses de la virulence, le sérotype, les facteurs de toxicité et la résistance aux médicaments
Applications liées au reséquençage microbien :
- Métagénomique des amplicons
- Le séquençage de novo
- Séquençage des plasmides
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